在华东，上海和长江口以南的杭州湾，莫特麦克唐纳承担了一项具有国际重要影响的环境研究课题。由莫特麦克唐纳与荷兰代尔夫特水力学研究所（Delft
Hydaulics）和威尔士国际水务（Welsh Water
International）组成的联营体，受委托对这一片因上游城市生活污水、工农业废水及海上船舶废弃物排放而受到不同程度污染的重要河道和海洋的环境进行了调查。这一问题的严重程度表现在每年出现的“赤潮”中（因大量海洋生物中毒后集中死亡引起海洋变色而得名）。
在中国的大多数城市中，工业污水排放是最主要的污染源，占污染物总负荷的70—80%，其中只有不到三分之一得到了预处理。上海市的工业包括化工、纺织、造纸、食品、金属和制药。这些工业都是高度污染行业，持续不断地将有机和金属污染物排放到杭州湾，是纳污能力评价中最主要的因素。
该研究强调，在保护和发展海产品供应的同时，需要挖掘杭州湾自然环境的纳污能力。在可持续的废弃物处置和可持续环境管理之间要达致平衡。
该调查包括三个部分：首先是定义主要的污染“热点”问题，以制定短期的行动计划；其次为对主要污染排放物进行分析，通过建立复杂的计算机模型对杭州湾的纳污能力进行评价；最后为制定一个环境保护和管理计划，包括相应的费用计划和资金计划，并就机构能力建设和规章制度安排提出建议。
培训和技术转让也是本项目的一个重要组成部分。
